Với tôn chỉ “thượng tôn pháp luật” và thực hiện nguyên tắc “người gây ô nhiễm phải trả tiền”, vì vậy, đối với bất kỳ khu công nghiệp, nhà máy, các cơ sở sản xuất xả nước thải và khí thải chưa qua xử lý ra môi trường hoặc xả thải vượt quy chuẩn kỹ thuật quốc gia về môi trường đều bị xử lý nghiêm như: phạt tiền hoặc bị đình chỉ hoạt động và công khai thông tin trên mạng thông tin điện tử. Đối với một số cơ sở có nguy cơ gây ô nhiễm môi trường cao đến mức phải “giám sát đặc biệt”, Bộ Tài nguyên và Môi trường đã và đang triển khai Nhiệm vụ “kiểm soát, giám sát đặc biệt các cơ sở có nguy cơ gây ô nhiễm môi trường cao” nhằm hạn chế tối đa mức độ xảy ra ô nhiễm môi trường. 

Trong thời gian qua, Bộ Tài nguyên và Môi trường đã phối hợp với các địa phương giám sát tốt nhiều cơ sở như: Công ty TNHH Gang thép Hưng Nghiệp Formosa Hà Tĩnh; các cơ sở, dự án thuộc Khu kinh tế Nghi Sơn tại tỉnh Thanh Hóa; các dự án khai thác khoáng sản tại Tây Nguyên: Nhà máy Alumina Nhân Cơ của Công ty Nhôm Đắk Nông - Tập đoàn Than và Khoáng sản Việt Nam (TKV); Tổ hợp Bauxite-Nhôm Lâm Đồng của Công ty Nhôm Lâm Đồng - TKV; các dự án tại Khu kinh tế Dung Quất: Công ty TNHH MTV Lọc - Hoá dầu Bình Sơn (Nhà máy lọc dầu Dung Quất); Công ty cổ phần Bột - Giấy VNT19 (Dự án Nhà máy Bột - Giấy VNT19); Công ty Cổ phần thép Hòa Phát Dung Quất (Dự án Khu liên hợp sản xuất gang thép Hòa Phát Dung Quất); Nhà máy giấy Lee&Man, Trung tâm Điện lực Vĩnh Tân, Trung tâm Nhiệt điện Duyên Hải và Trung tâm điện lực Sông Hậu. Ngoài ra, ngay sau khi nhận được phản ánh của người dân, tổ chức về việc phát hiện nhà máy xả thải không qua xử lý, các đơn vị có chức năng ngay lập tức trình cấp có thẩm quyền thành lập Đoàn thanh tra đột xuất và xử lý nghiêm các vi phạm theo đúng quy định của pháp luật.