Tại các địa phương, tổ chức bộ máy và đội ngũ công chức làm công tác pháp chế ngành tài nguyên và môi trường khá mỏng, các Sở Tài nguyên và Môi trường không thành lập được tổ chức pháp chế. Việc xây dựng Kế hoạch theo dõi tình hình chưa thể bao quát, toàn diện nên dẫn đến công tác kiểm tra chưa kịp thời để tháo gỡ khó khăn, vướng mắc trong từng lĩnh vực tài nguyên môi trường do những vướng mắc về thẩm quyền, trình tự, thủ tục ban hành văn bản quy phạm pháp luật.

Thời gian qua, công tác về tổ chức, bộ máy, biên chế làm công tác theo dõi theo dõi thi hành pháp luật luôn được Bộ quan tâm kiện toàn. Tuy nhiên, trong bối cảnh chung của bộ máy hành chính (chủ trương tinh giản bộ máy, biên chế) biên chế hiện nay của Bộ còn hạn hẹp nên việc bố trí cán bộ gặp nhiều khó khăn, đội ngũ cán bộ làm công tác pháp chế hiện vẫn còn thiếu, trong khi đó việc bố trí, điều chuyển, bổ sung biên chế làm công tác pháp chế gặp nhiều khó khăn; kinh nghiệm, năng lực trình độ của một số cán bộ, công chức làm công tác theo dõi thi hành pháp luật của một số đơn vị và địa phương còn hạn chế về số lượng, chất lượng chưa đáp ứng kịp thời yêu cầu, nhiệm vụ. Đồng thời, kinh phí 5 bố trí chi cho công tác theo dõi tình hình thi hành pháp luật chưa đáp ứng yêu cầu thực tiễn, chưa có mục chi riêng mà bố trí chung vào nguồn chi hành chính, vì vậy, kính phí dành cho công tác này còn hạn chế.